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| Escena de Jupiter Ascending |
- En la escena en la que Neo camina por fuera del edificio de su trabajo huyendo de los agentes, Keanu Reeves no usó un doble.
- Los hermanos Wachowski querían que Johnny Depp interpretara a Neo. Por otro lado, Warner tenía los ojos en Brad Pitt o Val Kilmer. Después de que ellos y Tom Cruise, Will Smith, Ewan McGregor, Leonardo DiCaprio y Nicolas Cage rechazaran el papel, Keanu se quedó con él.
- Para la escena del entrenamiento, utilizaron muchos pares de gemelos. Esto porque tenían en mente que la Matrix fuera un programa que se repitiera constantemente. En lugar de usar dobles o efectos especiales, decidieron hacerlo de esta manera.
- El club en el que grabaron la escena donde Neo conoce a Trinity es real. Todas las personas ahí son asistentes comunes que acostumbran usar trajes de látex.
- Muchos de los edificios en Matrix fueron usados también en otra película de ciencia ficción llamada Dark City. Lograron reducir el presupuesto al reutilizar estos sets.
- La secuencia de la batalla en el lobby tomó 10 días de filmación. Esto porque todos los efectos son reales. Lo único que se hizo de manera digital fue remover las cuerdas que sostenían a Trinity y a Neo en sus escenas de vuelo.
- Justo antes de empezar a filmar, Keanu Reeves fue sometido a una cirugía de columna vertebral. Como parte de su recuperación, tenía prohibido patear. Sus coreografías tuvieron que adaptarse a esta situación y es la razón por la vemos a Neo combatir mejor con las manos que con los pies.
